Остров Сан-Томе, открытый в 1469-1471 годах португальскими мореплавателями, находится в Гвинейском заливе и омывается водами Атлантического океана. Это самый большой остров государства Сан-Томе и Принсипи. Занимает 854 квадратных километров площади. Вместе с прилегающими островками, образует провинцию Сан-Томе с одноименным административным центром. Ширина острова примерно 32 километра, длина примерно 48 километров. Расположен в двух километрах к северу от экватора. Происхождение Сан-Томе вулканическое. Две трети территории занимают горы. Самая высшая точка достигает 2.024 метра (гора Пику-де-Сан-Томе). Берега скалистые и крутые. В кратерах есть маленькие озера. Климат острова влажный и жаркий, он переходит от экваториального к тропическому морскому. Территория подвержена засухам. Почвы преимущественно песчаные кислые, они сформированы на вулканических породах. Склоны гор покрыты тропическими лесами, цитрусовыми и персиковыми деревьями. С 1990 года Евросоюзом спонсируется программа по консервации лесов Сан-Томе. Население острова составляет 146.000 человек. В основном здесь проживают сантомейцы.