Когда-то здесь выращивались медицинские растения, а также овощи и фрукты, размещалась астрономическая обсерватория, создавались фонтаны, водные каскады, высаживались редкие виды растений и даже был открыт Ватиканский зоопарк. Каждый римский папа придумывал что-то свое. Сейчас это разнообразные газоны, заросли сосен, дубов, кипарисов, пальм, многочисленные постройки, в том числе административные здания и гелиопорт, связывающий Папское государство с римскими международными аэропортами. Посетить Ватиканские сады можно лишь по предварительной договорённости и обязательно с экскурсоводом.